Структура и функционирование белков. Применение методов биоинформатики - Джон Ригден 2014
Предсказание функции белка по свойствам его поверхности
Предсказание функций по свойствам поверхности
Консервативность поверхности
Консервативность поверхности, оцениваемая с помощью алгоритма ConSurf, оказалась полезной при предсказании функций некоторых белков. Одним из примеров ее использования является анализ белков лектина С-типа (англ. C-type lectin (CTLs) Proteins), находящихся на поверхности Клетки и связывающих Гликопротеины, вовлеченные в Иммунитет и эндоцитоз (Ebner et al. 2003). Эти Белки имеют структуру, очень похожую на структуру доменов, подобных лектину С-типа (англ. C-type lectin like domains, CTLDs), но последние не могут связывать функциональные группы углеводов. Анализ всех субъединиц домена с помощью программы ConSurf оказался полезным при выявлении остатков, составляющих консервативную поверхность и определяющих активные центры белков CTL. Такие остатки совершенно отсутствует у доменов, подобных CTL, и это различие было использовано при классификации CTL/CTLD доменов с неизвестной функцией.
Последнее обновление: 05/02/2024
Редакционная и учебная адаптация: Данный материал сведен на основе первоисточника/оригинального текста. Команда проекта осуществила редакционную обзорную обработку, исправление технических неточностей, структурирование разделов и адаптацию содержания к учебному формату.
Что было обработано:
- устранение форматных дефектов (OCR-ошибки, разрывы структуры, дефектные символы);
- редакционное упорядочивание содержания;
- унификация терминов в соответствии с академическими источниками;
- проверка соответствия фактических утверждений текста первоисточнику.
Все упоминания об авторе, годе издания и происхождении первичного текста сохранены в соответствии с источником.