Практическая химия белка - А. Дарбре 1989

Рентгеновская кристаллография и электронная микроскопия
Дифракция рентгеновских лучей
Конструирование моделей

Обработка и анализ экспериментальных данных завершается расчетом карты распределения электронной плотности внутри элементарной ячейки кристалла, которая хранится в памяти ЭВМ. Такая карта позволяет проследить ход полипептидной цепи молекулы, но еще не выявляет структуру на уровне атомного разрешения. Для перехода к атомному разрешению необходимо построить модель, «вписывающую» полипептидную цепь в карту электронной плотности с учетом известных стереохимических данных для полипептидного остова молекулы и боковых цепей образующих ее аминокислот. Для этого с помощью ЭВМ рассчитывают ряд сечений карты электронной плотности, которые в подходящем масштабе переносят на прозрачную пленку. Будучи сложенными в стопку, они воспроизводят распределение электронной плотности в элементарной ячейке кристалла. Однако без специальных приспособлений визуальный анализ структуры затруднен. Поэтому сечения или их выбранные районы укрепляются в вертикальной раме и освещаются сзади и сбоку. Перед рамой размещают полупрозрачное зеркало. Атомную модель молекулы собирают перед зеркалом так, чтобы ее зеркальное изображение совмещалось с картой распределения электронной плотности [11] (рис. 20.10).

РИС. 20.10. Устройство для конструирования проволочной модели белковой молекулы, отражающейся внутри карты электронной плотности. Полупрозрачное зеркало, находящееся в средней части устройства (между моделью и картой), убрано, для того чтобы карта электронной плотности была видна на фотоснимке.